燕窝可能导致免疫球蛋白E (IgE)介导的过敏反应，严重可引起儿童过敏性休克，表现为血管性水肿、腹部绞痛、荨麻疹、呼吸困难等 Ⅰ 型过敏反应的典型症状。
燕窝过敏原是一种相对分子质量为77 kDa的卵转铁蛋白类似物，另一种是相对分子质量为66 kDa的丝氨酸蛋白酶类似物，两种物质均存在于鸡蛋中，也可引起儿童过敏反应。
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常见的有哪些过敏食物？
联合国粮食与农业组织(FAO)和世界卫生组织(WHO)公布了八大类常见过敏食物，包括花生、大豆、鸡蛋、牛奶、甲壳类、 鱼类、坚果和小麦，90%以上的食物过敏反应都是由这8 类食物引起的。据统计，食物过敏影响近6～8%的儿童和2.5%的成年人。
图一、容易过敏的食物
1、海鲜类含有较高的异种蛋白，容易刺激机体的免疫细胞，诱发过敏反应。
2、果蔬类可能含有特殊的生物碱、有机物或易引发过敏的异体蛋白和酶。
3、坚果与种子类有常见的过敏原。
4、乳类与蛋类有常见的过敏原。
5、谷物类特别是小麦，对于非IgE介导的食物过敏。
在新加坡做过统计，对于当地儿童来说，花生是最主要的食物诱发因素（19％），其次是鸡蛋（12％），贝类（10％）和燕窝（10％）。在成年人中，贝类占66％，其次是坚果（6.7％），水果（6.7％），燕窝（3.3％），花生（3.3％）和鱼（3.3％）。以前，燕窝是引起过敏反应的最主要原因，但多年来已经改变。尽管新加坡的食物过敏程度相对较低，但鉴于贝类和花生是亚洲烹饪中普遍存在的隐藏食品，因此食物触发的过敏反应很常见也就不足为奇了。
某三甲医院皮肤科主任医师李博士指出，燕窝的营养非常丰富，许多体质虚弱的人都用它来补身体。一般情况下食用燕窝是不会过敏的，但是有些人对燕窝中的某些蛋白质或者对燕窝中残留的动物绒毛过敏，尤其是那些敏感体质的人群更容易发生过敏的症状。
食用燕窝如果清洗不够干净，有未剔除的杂质，特别是细小羽绒（含过敏性蛋白质），造成过敏反应者不少。如果燕窝干净度极好，可大大减少过敏反应。
有研究表明，利用糖蛋白分离方法去除过敏性成分，以期燕窝造福更多人群。
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